論文情報 2013年5月23日

Evaluation of whole wastewater effluent impacts on HepG2 using DNA microarray-based transcriptome analysis
Hara-Yamamura, H., Nakashima, K., Hoque, A., Miyoshi, T., Kimura, K., Watanabe, Y. and Okabe, S.
Environmental Science and Technology, in press.

膜分離活性汚泥法(MBR)及び従来の活性汚泥法(AS)の実下水処理水をヒト肝癌由来細胞(HepG2)に曝露し、DNAマイクロアレイを用いた遺伝子発現解析をおこなうことで、下水処理水のヒト培養細胞への影響評価を行った。並行して、全排水毒性の評価手法として確立されている従来のバイオアッセイ法(細胞毒性試験及びバクテリア発光阻害試験)を実施した。遺伝子発現解析結果より、処理水及び下水原水に曝露されたHepG2において2~926遺伝子が有意に変動し、これらの遺伝子が0~225の生物学的プロセスに関与することが明らかとなった。MBR処理水のうち、比較的長い汚泥滞留時間(40日)及び比較的小さな膜の公称孔径(0.03 μm)を有するMBRがHepG2に対する影響が最も小さく、水道水のものと同程度であった。確認された遺伝子発現変動は、細胞毒性試験の結果と一致していた。また、致死的ではないものの有害となりうる影響について、その分子学的メカニズムに関する知見を得ることができた。さらに、「脂質代謝」、「内因性の刺激に対する応答」、及び「無機物質への応答」に関する遺伝子が、遺伝子マーカーとなる可能性が示唆された。現段階では、有害・無害な影響を完全に区別することはできないが、DNAマイクロアレイを用いたHepG2の遺伝子発現解析は下水処理水全体の影響を迅速かつ包括的に評価するために有効な手法であることを示した。

北海道大学

より詳細な情報は以下のページをご覧下さい。
>>Full paper

本研究は、JST CREST「持続可能な水利用を実現する革新的な技術とシステム」研究領域により遂行されました。ここに深甚なる謝意を表します。

論文情報 2013年4月22日

Acetate oxidation by syntrophic association between Geobacter sulfurreducens and a hydrogen-utilizing exoelectrogen
Kimura, Z. and Okabe, S.
The ISME Journal, in press.

酢酸をエネルギー源とする微生物燃料電池(MFC)の陰極バイオフィルムの微生物群集構造を安定同位体標識法(DNA-SIP法)及び変性剤濃度勾配ゲル電気泳動法により解析した結果、Geobacter属細菌とHydrogenophaga属細菌の優占を確認した。これらのうちGeobacter属細菌については酢酸をエネルギー源とするMFCの主たる電気生産細菌であることが既に報告されていたが、一方でHydrogenophaga属細菌の生態学的役割については未解明であった。我々はMFCの陰極バイオフィルムからHydrogenophaga属細菌を分離することに成功し、その生態学的役割の解明に取り組んだ。分離したHydrogenophaga属細菌(Hydrogenophaga sp. AR20株と命名)は陰電極存在下で水素を酸化することができたが、一方で酢酸の分解能力を持たなかった。このことはAR20株が、水素資化性電気生産細菌であることを意味した。またこの成果は、嫌気的酢酸酸化能力を有するGeobacter属細菌と水素酸化能力を持つHydrogenophaga属細菌との間に異種間水素伝達による共生関係が成立することを示唆した。この仮説を証明するために、我々はG. sulfurreducens PCA株とHydrogenophaga sp. AR20株を酢酸をエネルギー源とするMFCで共培養した。結果、共培養MFCはそれぞれの菌株の純粋培養MFCよりも高い電流値及び酢酸消費量を示した。また、共培養MFCにおいてのみAR20株は増加した。これらの成果はGeobacter属細菌とHydrogenophaga属細菌が共生的電気生産により電極への電子伝達を行うことを示した最初の報告である。

北海道大学

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本研究の遂行に不可欠であったGeobacter sulfurreducens PCA株は、宮崎大学・井上謙吾助教によりご提供頂きました。また本研究は、JST CREST「持続可能な水利用を実現する革新的な技術とシステム」研究領域、JSPS科学研究費補助金・挑戦的萌芽研究(23246094)、およびJSPS特別研究員奨励費(11J04417)により遂行されました。ここに深甚なる謝意を表します。

論文情報 2013年4月12日

Simultaneous quantification of multiple food and waterborne pathogens by use of microfluidic quantitative PCR
Ishii, S., Segawa, T. and Okabe, S.
Applied and Environmental Microbiology, 2013, 79(9), 2891-2898.

従来の糞便指標菌による間接的な環境リスク評価では、病原微生物の存在を正確に把握することができなかった。より正確なリスク評価を目指して、本研究ではマイクロ流体工学に基づく定量的PCR(下図)を応用することにより、複数の病原微生物を同時一斉に検出・定量する手法を世界に先駆けて開発した。本手法は、感度が高く、低濃度で存在する病原体を検出・定量することができる。また、糞便や環境水などの環境試料にも適用可能であるため、今後のリスクモニタリング手法としても有望である。

北海道大学

本論文はApplied and Environmental Microbiology誌で注目すべき論文として紹介されています。
>>Spotlight

より詳細な情報は以下のページをご覧下さい。
>>Full paper

本研究は、JST CREST「持続可能な水利用を実現する革新的な技術とシステム」研究領域、JSPS科学研究費補助金・基盤A(23246094)、および上原記念生命科学財団により遂行されました。ここに深甚なる謝意を表します。

水質変換工学ニュース

  • 2013/5/17以下の発表がASM2013(Denver, Colorado, May 18-21, 2013)で行われます。→終了しました。

    >Poster presentation
    Simultaneous quantification of multiple food and waterborne pathogens by use of microfluidic quantitative PCR
    Satoshi Ishii, Takahiro Segawa, and Satoshi Okabe

    Improvement of quantification of bacterial genetic markers by using a genetically-engineered strain of Escherichia coli as a process control
    Ayano Kobayashi, Daisuke Sano, Satoshi Ishii and Satoshi Okabe

    学会の詳細はこちらをご覧下さい→ASM2013
  • 2013/5/13三浦JSPS特別研究員及び佐野准教授による解説文「水環境中の病原ウイルス分析手法」が水環境学会誌5月号に掲載されています。
  • 2013/5/15月1日付けで田代陽介JSPS特別研究員が静岡大学大学院工学研究科化学バイオ工学専攻にテニュアトラック助教として赴任しました。
  • 2013/4/18卒論生7名が研究室メンバーに加わりました。
  • 2013/4/1博士課程学生1名が研究室メンバーに加わりました。
  • 2013/3/25水戸が平成24年度(財)北海道大学クラーク記念財団「クラーク賞」を受賞しました。クラーク賞は、学業成績優秀で品行方正な学部卒業生に贈呈されるものです。Congratulations!!!
  • 2013/3/8The 47th Joint Working Conference on Immunology and Viral Diseases, US-Japan Cooperative Medical Science Program (Mandarin Oriental Hotel, Singapore, March 12th-13th, 2013)にて以下の発表が行われます。→終了しました。

    A hidden relationship between norovirus and enteric bacteria: norovirus exploits histo-blood group antigen-like substances on bacterial cells for its better survival in nature?
    Sano, D., Miura, T., Yoshimura, T., Fuzawa, M., Nakagomi, T., Nakagomi, O., and Okabe, S.

    Conrefence details are here→47th Joint Working Conference on Immunology and Viral Diseases
  • 2013/3/1The 3rd Young Professors and Students Symposium, NSFC-JST Joint Research Program (Xi'an, China, March 7th, 2013)にて以下の発表が行われます。→終了しました。

    Simultaneous quantification of multiple waterborne pathogens by use of microfluidic quantitative PCR
    Ishii, S., Segawa, T., and Okabe, S.

    Direct quantification of pathogens in natural and irrigation water samples for risk assessment
    Nakamura, T., Ishii, S., and Okabe, S.

    Towards mechanistic understanding of anaerobic nitrate-dependent Fe(II) oxidation
    Jokai, K., Ishii, S., and Okabe, S.

  • 2013/2/20JST CREST「水循環の基盤となる革新的水処理システムの創出」第1回公開シンポジウムが秋葉原UDX(http://udx.jp/)8階会議室で行われます。→終了しました。

    北海道大学

  • 2013/2/5北海道大学・環境社会工学科・衛生環境工学コースのホームページがリニューアルしました。
    新ホームページはこちら→衛生環境工学コース
  • 2013/2/5第47回日本水環境学会年会(大阪工業大学、 2013年3月11-13日)にて以下の発表が行われます。→終了しました。

    1-J-16-2:ヒト神経細胞株を用いた凝集剤由来アルミニウムの毒性評価
    山田雪絵、May Thithiwat、岡部 聡

    2-D-09-1:MBR 膜ファウリングを支配する細菌の探索
    井川裕介、三好太郎、渡辺義公、岡部 聡

    2-D-11-4:親水性細胞外多糖(コラン酸)の生産が膜ファウリングに与える影響
    吉田圭太朗、田代陽介、May Thithiwat、岡部 聡

    2-J-09-1:大腸菌のバイオフィルム内における小コロニー形成株の発生原因と生態学的役割の解析
    榮田弘明、田代陽介、石井 聡、岡部 聡

    3-J-10-2:表面プラズモン共鳴を利用した病原微生物バイオセンサの開発
    坂槙有紀恵、佐野大輔、高橋正宏、岡部聡、佐藤久

    2-J-10-4:環境サンプル測定のためのリン酸マイクロセンサーの開発
    宮崎悠爾、谷内 翔、高橋正宏、岡部 聡、佐藤 久

    2-J-11-1:リン酸マイクロセンサーのイオノフォアの検討
    谷内 翔、宮崎悠爾、高橋正宏、岡部 聡、佐藤 久

    3-E-09-2:プロトン供給促進による一槽式バイオ燃料電池の高出力化
    石崎 創、佐野大輔、岡部 聡

    3-H-10-2:遺伝子発現解析に基づく再生水中残留医薬品の毒性評価
    中島弘司、原(山村)宏江、渡辺義公、岡部 聡

    3-J-09-1:網羅的重金属イオン分析に向けた新規変色型蛍光色素の開発
    吉川弘晃、羽深 昭、菅藤亮輔、大屋光平、山田幸司、高橋正宏、岡部 聡、佐藤 久

    3-J-09-2:新規変色型蛍光色素を用いた路面排水中亜鉛濃度の定量
    菅藤亮輔、羽深 昭、吉川弘晃、大屋光平、山田幸司、高橋正宏、岡部 聡、佐藤 久

    3-J-11-4:環境水中からのFCM-FACS を用いた大腸菌O157 の単離手法の開発
    小澤就志、石井 聡、岡部 聡

    3-C-14-1:ヒト腸内細菌由来リポ多糖へのヒトノロウイルス粒子吸着評価
    麸沢美裕、吉村 岳、佐野大輔、岡部 聡

    3-C-14-2:胃腸炎ウイルス感染能力評価への外殻タンパク質酸化ストレスマーカーの適用
    太田崇智、佐野大輔、岡部 聡

    3-C-14-3:病原体の許容感染リスクに基づく水質基準設定方法の検討- 遺伝子マーカーの利用-
    小林彩乃、佐野大輔、石井 聡、岡部 聡

    3-C-14-4:複数種病原体の同時一斉検出・定量手法の開発
    石井 聡、瀬川高弘、岡部 聡

    3-E-15-2:Hydrogenophaga sp. AR20のGeobacter sulfurreducensとの水素を介した共生的電気生産
    寺田浩太朗、木村善一郎、石﨑 創、岡部 聡

    3-H-13-3:ヒト由来培養細胞を用いた塩素消毒下水処理水の毒性評価
    福島寿和、三好太郎、木村克輝、渡辺義公、岡部 聡

    3-H-13-4:細胞応答に基づいた膜処理再生水中の毒性画分の探索-粒径に着目して
    原(山村)宏江、Asiful Hoque、三好太郎、木村克輝、渡辺義公、岡部 聡

    L-70:重金属測定用蛍光色素の理論的分子設計による高感度化
    大屋光平、羽深 昭、菅藤亮輔、吉川弘晃、山田幸司、高橋正宏、岡部 聡、佐藤 久

    L-77:表面プラズモン共鳴を利用した大腸菌O157 バイオセンサの開発
    山田健太、Pitakteeratham Niti、坂槙有紀恵、石井 聡、高橋正弘、岡部 聡、佐藤 久

    学会の詳細はこちらをご覧下さい→第47回日本水環境学会年会
  • 2013/1/29Hafukaらの論文(BODIPY-based retiometric fluoroionophores with bidirectional spectral shifts for the selective recognition of heavy metal ions)が、Bulletin of the Chemical Society of Japan、86巻1号の優秀論文に選ばれました。

    北海道大学

  • 2013/1/22The 16th International Symposium on Toxicity Assessment(Cape Town, South Africa、 2013年2月21-26日)にて以下の発表が行われます。→終了しました。

    Toxicity assessment of chlorinated treated wastewater by using toxicogenomics approach
    Fukushima, T., Miyoshi, T., Kimura, K., Watanabe, Y., and Okabe, S.

    Toxicogenomic-based water quality evaluation of reclaimed water: Potential effects of pharmaceutical residues in treated wastewater
    Nakashima, K., Hara-Yamamura, H., Asiful, H., Miyoshi, T., Kimura, K., Watanabe, Y., and Okabe, S.

    学会の詳細はこちらをご覧下さい→ISTA16
  • 2013/1/18土木学会北海道支部年次技術研究発表会(函館高専高等専門学校、 2013年2月2-3日)にて以下の発表が行われます。→終了しました。

    環境サンプル測定のためのリン酸マイクロセンサーの開発
    宮崎悠爾、谷内 翔、押木 守、佐藤 久、高橋正宏、岡部聡

  • 2013/1/17The 2nd Water Research Conference(Singapore、 2013年1月20-23日)にて以下の発表が行われます。→終了しました。

    Microsensor measurements of nitrous oxide and nitric oxide production rates in partial nitrification and anammox granules
    Rathnayake, R. M. L. D., Satoh, H., Takahashi, M., and Okabe, S.

    学会の詳細はこちらをご覧下さい→The 2nd Water Research Conference
  • 2013/1/16岡部教授による解説文「水の再生と再利用の鍵:「膜分離技術」と「バイオテクノロジー」の融合」が水環境学会誌1月号に掲載されています。
  • 2013/1/16Global Leadership Initiative Special Workshop on Water Virology(上野パークサイドホテル、 2013年1月19日)にて以下の発表が行われます。→終了しました。

    Performance target of enteric virus removal with MBR
    Sano, D., Miura, T., and Okabe, S.

  • 2013/1/15押木守JSPS特別研究員が、約1年の予定でオランダのRadboud Universityに派遣されました。
  • 2013/1/7第4回国際水ソリューション総合展(InterAqua2013、東京ビッグサイト東4ホール)において、1月30日午後に「水環境の基盤となる革新的水処理システムの創出」と題した岡部教授の講演が行われます。
  • 2012/12/27平成24年度水系研究室修士論文中間発表会において、中島が優秀発表賞(2位)を、小澤が優秀発表賞(3位)を受賞しました。Congratulations!!!
  • 2012/12/17第4回国際水ソリューション総合展(InterAqua2013、東京ビッグサイト東4ホール、2013年1月30日-2月1日)にて、JST CREST「持続可能な水利用を実現する革新的な技術とシステム」研究領域における岡部チームプロジェクト「水循環の基盤となる革新的水処理システムの創出」の研究成果が展示されます。

    展示会の詳細はこちらをご覧下さい→InterAqua2013
  • 2012/12/5以下の発表がBiofilms 5(Paris、2012年12月10-12日)で行われます。→終了しました。

    Bacteriophage resistant mechanisms of mature Escherichia coli biofilms
    May, T., Tsuruta, K., and Okabe, S.

  • 2012/11/30第49回環境工学研究フォーラム(京都大学、2012年11月28-30日)にて、田澤が優秀ポスター発表賞を受賞しました。Congratulations!!!
    北海道大学

  • 2012/11/21以下の発表が4th Asia-Pacific Young Water Professionals Conference 2012 (日本科学未来館、東京、2012年12月7-10日)で行われます。→終了しました。

    >Academic Session B-6
    Multiple peak expression of enteric virus density in environmental water
    Sano, D., Kato, T., Kobayashi, A., Miura, T. and Okabe, S.

    >Health-Related Water Microbiology Special Session 1
    Bacteroides-Prevotella genetic markers as fecal pollution indicators for microbiologically safe water management
    Kobayashi, A., Sano, D., Ishii, S. and Okabe, S.

    >Health-Related Water Microbiology Special Session 2
    Risk assessment for viral infection via drinking water considering age-dependent susceptibility
    Watanabe, T., Itoh, H., Sano, D., and Okabe, S.

    学会の詳細はこちらをご覧下さい→4th Asia-Pacific Young Water Professionals Conference 2012
    Health-Related Water Microbiology Special Sessionのプログラムはこちら
  • 2012/11/5以下の発表が第49回環境工学研究フォーラム(京都大学、2012年11月28-30日)で行われます。→終了しました。

    >自由投稿セッション
    Development of an aerobic granule sequencing batch airlift reactor for partical nitrification
    宋延軍、石井聡、岡部聡

    細胞応答を活用した感染性ウイルス検出手法の開発
    田澤恵、三浦尚之、佐野大輔、岡部聡

    ヒトノロウイルス粒子を特異的に捕捉するヒト腸内細菌由来細胞外物質に関する研究
    吉村岳、三浦尚之、佐野大輔、岡部聡

    >環境技術プロジェクトセッション
    環境サンプル測定のためのリン酸マイクロセンサーの開発
    宮崎悠爾、谷内翔、高橋正宏、岡部聡、佐藤久

    表面プラズモン共鳴を利用した病原微生物バイオセンサの開発
    坂槙有紀恵、山田健太、ピタックティーラタム ニティ、石井聡、佐野大輔、高橋正宏、岡部聡、佐藤久

    新規蛍光分子プローブを用いた環境水中重金属イオン分析
    菅藤亮輔、大屋光平、吉川弘晃、羽深昭、山田幸司、高橋正宏、岡部聡、佐藤久

    学会の詳細はこちらをご覧下さい→第49回環境工学研究フォーラム
  • 2012/10/20以下の発表が第64回日本生物工学会大会(神戸国際会議場、2012年10月23-26日)で行われます。→終了しました。

    大腸菌RelEが誘導する菌体密度依存的休眠化
    岡部聡、田代陽介、谷内亜沙美、May Thithiwat、柿沼建至、川田耕司

  • 2012/10/1客員研究員1名と修士課程学生3名が研究室メンバーに加わりました。
  • 2012/9/25第18回バイオアッセイ研究会・日本環境毒性学会・合同研究発表会にて、原が奨励賞を受賞しました。Congratulations!!!
  • 2012/9/21以下の発表が3rd Food and Environmental Virolgoy Conference (Lisbon, 2012年10月7-10日) で行われます。→終了しました。

    Infectivity of gastroenteritis viruses analyzed by oxidative stress marker detection and RNase sensitivity test
    Sano, D., Miura, T., Tojo, K., Otani, M. and Okabe, S.

    Enteric bacteria bearing histo-blood group antigen-like extracellular polymeric substances as environmental vehicles for human noroviruses
    Miura, T., Sano, D., Suenaga, A., Yoshimura, T., Nakagomi, T., Nakagomi, O. and Okabe, S.

    学会の詳細はこちらをご覧下さい→3rd Food and Environmental Virolgoy Conference
  • 2012/9/19北海道大学大学院工学研究院・英語コース(English Engineering Education Program, Hokkaido University)の紹介ビデオに研究室メンバーが出演しています。


  • 2012/9/13以下の発表がIWA World Water Congress & Exhibition (Busan, 2012年9月16-21日) で行われます。→終了しました。

    FISH case study
    Okabe, S.

  • 2012/9/13以下の発表がIWA Nutrient Removal and Recovery 2012 (Harbin, 2012年9月23-25日) で行われます。→終了しました。

    >Keynote Speech
    N2O emission from a partial nitrification-anammox process
    Okabe, S.

    >Poster presentation
    Elucidating the ecophysiology of an anammox bacterium, Candidatus ‘Brocadia sinica’, by metagenomic approach
    Oshiki, M., Shinyako, K., Satoh, H., and Okabe, S.

    学会の詳細はこちらをご覧下さい→IWA Nutrient Removal and Recovery 2012
  • 2012/9/13以下の発表が第28回日本微生物生態学会 (豊橋技術科学大学、2012年9月19-22日) で行われます。→終了しました。

    嫌気性アンモニア酸化細菌 Candidatus ‘Brocadia sinica’のメタゲノム解析による新規アナモックス代謝経路の同定
    押木守、新家子香織、佐藤久、岡部聡
    ポスター発表

    Syntrophic acetate oxidation by the couple of anaerobic acetate oxidizing bacteria and hydrogenotrophic exoelectrogenic bacteria in the MFC fed with acetate
    Kimura, Z., Terada, K., and Okabe, S.
    Poster Presentation

    大腸菌バイオフィルム内で発生する小コロニー形成株の特性解析
    栄田弘明、田代陽介、岡部聡
    ポスター発表

    学会の詳細はこちらをご覧下さい→第28回日本微生物生態学会
  • 2012/9/10以下の発表が第18回バイオアッセイ研究会・日本環境毒性学会・合同研究発表会 (熊本ANAホテルニュースカイ、2012年9月23-24日) で行われます。→終了しました。


    水再利用を目的とした塩素消毒下水処理水の毒性評価 -トキシコゲノミクス的アプローチを用いた網羅的な毒性評価-
    福島寿和、三好太郎、木村克輝、渡辺義公、岡部聡

    トキシコゲノミクス的アプローチを用いた都市下水処理水の評価 -処理水中残留成分が医薬品の毒性にもたらす影響-
    中島弘司、原(山村)宏江、Asiful Hoque、木村克輝、岡部聡、三好太郎、渡辺義公

    細胞応答に基づいた膜処理水下水中の毒性画分の探索
    原(山村)宏江、木村克輝、岡部聡、三好太郎、渡辺義公

    学会の詳細はこちらをご覧下さい→第18回バイオアッセイ研究会・日本環境毒性学会・合同研究発表会
  • 2012/9/10以下の発表が第15回日本水環境学会シンポジウム (佐賀大学、2012年9月10-11日) で行われます。→終了しました。

    嫌気性アンモニア酸化(アナモックス)細菌のゲノム解析が明らかにする生理学的特性
    押木守、新家子香織、佐藤久、岡部聡

    表面プラズモン共鳴を利用した水中病原微生物検出 バイオセンサの開発
    佐藤久、坂槙有紀恵、山田健太、ピタックティーラタム・ニティ、石井聡、佐野大輔、高橋正宏、岡部聡

    学会の詳細はこちらをご覧下さい→第15回日本水環境学会シンポジウム
  • 2012/8/19ISME14にて、平泉がTravel Awardを受賞しました。Congratulations!!!
  • 2012/8/17以下の発表がISME14 (Copenhagen, Aug. 19-24, 2012) で行われます。→終了しました。

    Physiological characteristics of marine anammox bacteria enriched from sea sediments, Hiroshima, Japan
    Awata, T., Kindaichi, T., Ozaki, N., Ohashi, A., Oshiki, M., and Okabe, S.
    Poster presentation

    Meta-genomic analysis for the elucidation of physiology of an anammox bacterium, Candidatus 'Brocadia sinica'
    Mamoru Oshiki, Kaori Shinyako, Hisashi Satoh and Satoshi Okabe
    Poster presentation

    Reduction of folate synthesis represses biofilm formation by decreasing curli fimbriae synthesis in Escherichia coli
    Yosuke Tashiro and Satoshi Okabe
    Poster presentation

    Cell density-dependent anaerobic ammonium oxidation (anammox) activity of Candidatus 'Brocadia sinica'
    Haruna Hiraizumi (The ISME Travel Award winner), Mamoru Oshiki and Satoshi Okabe
    Poster presentation

    学会の詳細はこちらをご覧下さい→ISME14
  • 2012/8/1710月17日に北海道大学附属図書館・本館メディアコートで行われるSTAND UP TAKE ACTION in Hokudaiにおいて、佐野准教授によるミニ講演が行われます。

    詳細はこちらをご覧下さい→STAND UP TAKE ACTION in Hokudai
  • 2012/8/912月4日に平成24年度北海道大学衛生工学シンポジウムが北海道大学・学術交流会館で行われます。

    プログラム予定
    20周年記念シンポジウム「衛生環境工学のこれからと北大の役割」
    ワークショップ「北海道の土・水・大気における窒素汚染とその対策(仮題)」

    詳細はこちらをご覧下さい→北海道大学衛生工学シンポジウム
  • 2012/8/6日本海水学会誌の最新号(第66巻、第4号、191-196)に、岡部教授の解説文「バイオフィルムの理解・制御から共存へ」が掲載されました。
  • 2012/7/26三浦尚之JSPS特別研究員が、約1年の予定でフランス海洋研究所・微生物学研究室(Laboratoire Microbiologie, Institue français de recherche pour l'exploitation de la mer (IFREMER))に派遣されました。
  • 2012/7/197月23日に北海道大学農学部 Wetland Seminar で石井助教の講演が行われます。→終了しました。

    第92回 Wetland Seminar
    「湿地環境における大腸菌の分布と生態」
    会場:北海道大学農学部N23講義室
    時間:18:30-
    申込・参加費:不要

      詳細はこちらをご覧下さい→第92回 Wetland Seminar
  • 2012/7/11北海道大学工学研究院・工学院広報誌えんじにあRing391号(2012年7月)の10ページ目に岡部教授の紹介が掲載されています。

    ▲クリックでダウンロードできます。
  • 2012/7/37月13日に以下の要領で特別セミナーが開催されます。→終了しました。

    「Implication of Microbial Community Structrues in Water Quality
    and Biogeochemical N Cycle」

    会場:北海道大学工学部A101

    時間:10:00-11:00

    講師:Dr. Bongkuen Song (University of North Carolina at Wilmington, NC, USA)

    ▲クリックでダウンロードできます。
  • 2012/6/116月20日に以下の要領で「札幌ウイルス性胃腸炎セミナー」が開催されます。→終了しました。

    「札幌ウイルス性胃腸炎セミナー」
    会場:京王プラザホテル札幌 3階「雅の間」
    時間:18:00〜20:00
    講師:Prof. M. K. Estes (Baylor College of Medicine, USA)
    Dr. F. S. Le Guyader (IFREMER, France)
    ▲クリックでダウンロードできます。
  • 2012/5/28以下の発表がASM General Meeting (San Francisco, June 16-19, 2012) で行われます。→終了しました。

    Localization and global gene expression during filamentous bacteriophage biofilm infection
    Thithiwat May and Satoshi Okabe
    Poster presentation

    Colanic acid production decreases bacterial attachment on membranes
    Keitaro Yoshida, Yosuke Tashiro, Thithiwat May and Satoshi Okabe
    Poster presentation
  • 2012/5/25以下の発表がEuropic2012(Saint Raphael, June 3-7, 2012)で行われます。→終了しました。

    Transcriptome analysis of intestinal epithelial cells infected with poliovirus type 1
    Megumi Tazawa, Takayuki Miura, Daisuke Sano and Satoshi Okabe

岡部先生からのメッセージ

“美しいかけがえのない水環境をいつまでも”をキーワードに,私達はバイオテクノロジーを駆使して環境汚染物質の分解・除去、DNAマイクロアレイを用いた水の安全性評価手法の開発、廃水(廃棄物)からクリーンな電気エネルギーの直接回収(バイオ燃料電池の開発)、などの研究を行っています。我々の環境、健康を守るという、今、最も重要なテーマに、君の若い力とエネルギーをぶつけてみませんか?環境バイオテクノロジーに興味を持ち、かつ、環境を良くしたいと思い、修士ならびに博士課程進学を希望する熱い学生を募集しています。興味を持った方は遠慮なく岡部まで!!

水質変換工学研究室では意欲ある博士課程後期学生を募集しています。

博士課程後期学生
研究内容:
トキシコゲノミクス的アプローチによる水の安全性評価手法の開発
バイオフィルム形成メカニズムの解析
Microbial Source Tracking
水環境を汚染する病原ウイルスの動態解明

その他:在籍中の経済的支援については個別に相談に応じます。
より詳細な情報は、「博士課程学生募集について」と題したメールにより問い合わせて下さい。
岡部聡 sokabe[at]eng.hokudai.ac.jp

更新履歴

  • 2013/5/23論文情報をトップページに掲載しました。
  • 2013/5/17水質変換工学ニュースを更新しました。
  • 2013/5/13メンバーページを更新しました。
  • 2013/4/3Water and Public Healthの講義資料をupしました。→こちら
  • 2013/3/26最近の講演・学会発表・動画を更新しました。
  • 2013/1/8微生物工学の講義資料をupしました。→こちら
  • 2012/12/27受賞一覧を更新しました。
  • 2012/11/7Environmental Biotechnologyの講義資料をupしました。→こちら
  • 2012/10/3分離工学の講義資料をupしました。→こちら
最近の講演・学会発表・動画

2013年3月13日
第47回日本水環境学会年会
(講演者:石井聡助教)

▲クリックで別画面表示されます



2013年3月25日
平成24年度追いコン用動画
(作成者:小澤就志)

▲Click Start

最近の学会発表
受賞一覧

平成25年3月25日
水戸が平成24年度(財)北海道大学クラーク記念財団「クラーク賞」を受賞しました。

平成24年12月27日
平成24年度水系研究室修士論文中間発表会において、中島が優秀発表賞(2位)を、小澤が優秀発表賞(3位)を受賞しました。

平成24年11月30日
第49回環境工学研究フォーラムにて、田澤が優秀ポスター発表賞を受賞しました。

平成24年9月25日
第18回バイオアッセイ研究会・日本環境毒性学会・合同研究発表会にて、原が奨励賞を受賞しました。

平成24年8月19日
ISME14にて、平泉がTravel Awardを受賞しました。

平成24年3月21日
大谷が平成23年度(財)北海道大学クラーク記念財団「クラーク賞」を受賞しました。

平成24年3月15日
第46回日本水環境学会年会にて、平泉が優秀発表賞(クリタ賞)を、石黒、中島が学生ポスター発表賞(ライオン賞)をそれぞれ受賞しました。

平成23年12月27日
平成23年度水系研究室修士論文中間発表会において、田澤が最優秀発表賞を、榮田が優秀発表賞(2位)を受賞しました。

平成23年11月7日
第3回北海道大学サステナビリティ学生研究ポスターコンテストにて、田澤が北海道大学総長賞(最優秀賞)を受賞しました。

平成23年10月10日
第27回日本微生物生態学会にて、田代JSPS特別研究員が論文賞を受賞しました。

平成23年10月10日
第27回日本微生物生態学会にて、押木JSPS特別研究員が優秀ポスター賞を受賞しました。

平成23年10月5日
第4回IWAアジア太平洋地域会議にて、東條がBest Student Awardを受賞しました。

平成23年9月10日
第14回水環境学会シンポジウムにて、佐野准教授がメタウォーター賞(年間優秀論文賞)を受賞しました。

平成23年7月13日
第2回国際硝化学会・第16回ヨーロッパ窒素循環会議にて、押木特別研究員が発表賞を受賞しました。

平成23年6月14日
第45回日本水環境学会年会にて、柿沼、新家子、藤木が優秀発表特別賞(クリタ賞)を、榮田、山田が学生ポスター発表賞(ライオン賞)をそれぞれ受賞しました。

平成23年5月19日
第1回国際アナモックスシンポジウムにて、押木特別研究員(JSPS)が最優秀講演賞を受賞しました。

平成22年12月27日
平成22年度水系研究室修士論文中間発表会において、鶴田が優秀発表賞(2位)を受賞しました。

平成22年11月25日
第26回日本微生物生態学会にて、新家子が最優秀ポスター賞を、榮田が日韓ポスター賞をそれぞれ受賞しました。

平成21年 3月18日
第43回日本水環境学会年会にて、羽鳥が年会優秀発表賞(クリタ賞)を受賞しました。

平成20年 3月22日
第42回日本水環境学会年会にて、大澤および下川が年会優秀発表賞(クリタ賞)を受賞しました。

平成19年 12月25日
岡部教授が日本学術振興会賞を受賞しました。

関連リンク